我曾在Python中问过类似的问题（如何基于pandas另一列中的唯一值创建升序列），并使脚本正常工作，但是由于各种原因，我现在需要在R中实现相同的目的。我在这里也增加了复杂性，因为希望能够定期向数据集中添加新的一批数据。
我有一个样本列表，这些样本具有唯一的样本ID号（“ Sample_ID”）。数据集的每一行都是一个样本。一些样本被重复多次。我想创建一组新的样本名称（“ Sample_code”），当您使用前缀（例如“ SAMP00001”，“ SAMP00002”等）在行中向下移动时，它们将从1升序。我希望保留行的顺序（因为它们大致按样本收集的日期顺序）。对于重复的样本，我希望为Sample_code给出的数字对应于样本ID出现在第一行，而不是表格后面的行（在样本收集的后面）。
我的起始数据用df1进行了说明：
# df1
Sample_ID <- c('123123','123456','123123','123789')
Date <- c('15/06/2019', '23/06/2019', '30/06/2019', '07/07/2019')
Variable <- c("blue","red","red","blue")
Batch <- 1
df1 <- data.frame(Sample_ID, Date, Variable, Batch)
df1
我想创建df1b中显示的Sample_code列：
# df1b
Sample_ID <- c('123123','123456','123123','123789')
Date <- c('15/06/2019', '23/06/2019', '30/06/2019', '07/07/2019')
Variable <- c("blue","red","red","blue")
Batch <- 1
Sample_code <- c('SAMP0001', 'SAMP0002', 'SAMP0001', 'SAMP0003')
df1b <- data.frame(Sample_ID, Date, Variable, Batch, Sample_code)
df1b
此时，我将保存df1b以及用于下游处理的那些Sample_code名称。之所以增加复杂性，是因为我随后将收集一批新的样本-我们将其称为df2（第2批样本）：
# df2
Sample_ID <- c('456789', '123654', '123123', '123789', '121212')
Date <- c('15/07/2019', '31/07/2019', '12/08/2019', '27/08/2019', '31/08/2019')
Variable <- c("blue", "red","blue", "red", "red")
Batch <- 2
df2 <- data.frame(Sample_ID, Date, Variable, Batch)
df2
我想将df2绑定到df1的底部，并为新行生成更多的Sample_code名称。重要的是，新的Sample_code名称需要考虑df1中存在的所有Sample_ID重复项，但也不要更改当我只有df1时已经分配回的任何Sample_code名称。此时的结果将是df2b，如下所示：
# df2b
Sample_ID <- c('123123','123456','123123','123789','456789', '123654', '123123', '123789', '121212')
Date <- c('15/06/2019', '23/06/2019', '30/06/2019', '07/07/2019', '15/07/2019', '31/07/2019', '12/08/2019', '27/08/2019', '31/08/2019')
Variable <- c("blue","red","red","blue","blue", "red","blue", "red", "red")
Batch <- c(1,1,1,1,2,2,2,2,2)
Sample_code <- c('SAMP0001', 'SAMP0002', 'SAMP0001', 'SAMP0003', 'SAMP0004', 'SAMP0005', 'SAMP0001', 'SAMP0003', 'SAMP0006')
df2b <- data.frame(Sample_ID, Date, Variable, Batch, Sample_code)
df2b
然后我将以相同的方式等添加批3样本
我知道至少有两个阶段可以解决此问题：1）使用唯一的Sample_ID值产生一个升序的Sample_code名称列表；2）以迭代的方式添加一批样品。但是由于第二点影响了我想要的Sample_code名称的功能，因此我在这里包括了两个阶段。
最后-理想情况下，我只想使用base R和tidyverse软件包。
任何帮助，不胜感激！谢谢。
因为您需要在分配示例代码之前了解所有可能的示例ID，所以请考虑通过调用rbind所有示例数据帧来反转顺序。然后使用级别分配Sample_codefactor。否则，请为每个批处理数据帧重新分配Sample_code。
# BUILD A LIST OF DATA FRAMES BY CALLING lapply ON ITERATIVE PROCESS
# df_list <- lapply(batch_iterable, method_to_build_sample)
df_list <- list(df1, df1b, df2) # FOR THIS PARTICULAR POST
# RBIND ALL DFs TOGETHER
df2b <- do.call(rbind, df_list)
df2b <- within(df2b, {
# CONVERT TO CHARACTER
Sample_ID <- as.character(Sample_ID)
# CONVERT TO FACTOR AT POSITIONED VALUES, THEN INTEGER FOR LEVEL NUMBER
Sample_code <- as.character(as.integer(factor(Sample_ID, levels = unique(Sample_ID))))
# RE-ASSIGN WITH SAMP AND LEADING ZEROS
Sample_code <- ifelse(nchar(Sample_code) == 1, paste0('SAMP000', Sample_code),
ifelse(nchar(Sample_code) == 2, paste0('SAMP00', Sample_code),
ifelse(nchar(Sample_code) == 3, paste0('SAMP0', Sample_code), NA)
)
)
})
df2b
# Sample_ID Date Variable Batch Sample_code
# 1 123123 15/06/2019 blue 1 SAMP0001
# 2 123456 23/06/2019 red 1 SAMP0002
# 3 123123 30/06/2019 red 1 SAMP0001
# 4 123789 07/07/2019 blue 1 SAMP0003
# 5 456789 15/07/2019 blue 2 SAMP0004
# 6 123654 31/07/2019 red 2 SAMP0005
# 7 123123 12/08/2019 blue 2 SAMP0001
# 8 123789 27/08/2019 red 2 SAMP0003
# 9 121212 31/08/2019 red 2 SAMP0006
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