skbio 模块的导入错误

阿萨德·谭

我正在运行 Python 3 并安装了skbio v0.5.5。按照本教程中的示例,我尝试为某些 skbio 类运行导入语句,但出现错误。例如,

from skbio.alignment import Alignment

结果是

导入错误:无法从“skbio.alignment”导入名称“对齐”

还,

from skbio import BiologicalSequence

结果是

导入错误:无法从“生物序列”导入名称“对齐”

我该如何解决?

克拉伦斯梁

Alignment班是从旧版本的skbio库,特别是从0.3版本之前。

如果您想使用这些类,则需要从该版本之前安装 scikit-bio,方法如下:

pip install scikit-bio==0.2

如果您只是在阅读《应用生物信息学导论》一书,就像您在评论中提到的那样,最好使用该书的最新版本,它将使用最新版本的 scikit-bio 库。

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