リモートMySQLデータベース（AWS RDS）に接続するようにRMySQLをインストールして設定するにはどうすればよいですか？

私の問題に関連するシステム情報：

AWS RDS DB Instance
Instance Class - db.m1.small
Engine - MySQL 5.6.13

AWS EC2 Linux AMI
https://aws.amazon.com/amazon-linux-ami/2014.03-release-notes/

R version 3.0.2
i686-redhat-linux-gnu (32-bit)

Linux MySQL packages installed:
mysql.noarch            5.5-1.6.amzn1        @amzn-main   
mysql-server.noarch     5.5-1.6.amzn1        @amzn-main   
mysql55.i686            5.5.37-1.46.amzn1    @amzn-updates
mysql55-common.i686     5.5.37-1.46.amzn1    @amzn-updates
mysql55-libs.i686       5.5.37-1.46.amzn1    @amzn-updates
mysql55-server.i686     5.5.37-1.46.amzn1    @amzn-updates

前述のAWSLinuxAMIにRをインストールしました。MySQLを実行しているRDSインスタンスからRデータフレームにデータをプルしようとしています。

現在のところ、DBIパッケージをRにインストールしましたが、RMySQLのインストールが次のエラーで失敗します。

$> R CMD INSTALL RMySQL_0.9-3.tar.gz
* installing to library ‘/usr/lib/R/library’
* installing *source* package ‘RMySQL’ ...
** package ‘RMySQL’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables... 
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ANSI C... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for compress in -lz... yes
checking for getopt_long in -lc... yes
checking for mysql_init in -lmysqlclient... no
checking for egrep... grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking mysql.h usability... no
checking mysql.h presence... no
checking for mysql.h... no
checking for mysql_init in -lmysqlclient... no
checking for mysql_init in -lmysqlclient... no
checking for mysql_init in -lmysqlclient... no
checking for mysql_init in -lmysqlclient... no
checking for mysql_init in -lmysqlclient... no
checking for mysql_init in -lmysqlclient... no
checking for mysql_init in -lmysqlclient... no
checking /usr/local/include/mysql/mysql.h usability... no
checking /usr/local/include/mysql/mysql.h presence... no
checking for /usr/local/include/mysql/mysql.h... no
checking /usr/include/mysql/mysql.h usability... no
checking /usr/include/mysql/mysql.h presence... no
checking for /usr/include/mysql/mysql.h... no
checking /usr/local/mysql/include/mysql/mysql.h usability... no
checking /usr/local/mysql/include/mysql/mysql.h presence... no
checking for /usr/local/mysql/include/mysql/mysql.h... no
checking /opt/include/mysql/mysql.h usability... no
checking /opt/include/mysql/mysql.h presence... no
checking for /opt/include/mysql/mysql.h... no
checking /include/mysql/mysql.h usability... no
checking /include/mysql/mysql.h presence... no
checking for /include/mysql/mysql.h... no

Configuration error:
  could not find the MySQL installation include and/or library
  directories.  Manually specify the location of the MySQL
  libraries and the header files and re-run R CMD INSTALL.

INSTRUCTIONS:

1. Define and export the 2 shell variables PKG_CPPFLAGS and
   PKG_LIBS to include the directory for header files (*.h)
   and libraries, for example (using Bourne shell syntax):

      export PKG_CPPFLAGS="-I<MySQL-include-dir>"
      export PKG_LIBS="-L<MySQL-lib-dir> -lmysqlclient"

   Re-run the R INSTALL command:

      R CMD INSTALL RMySQL_<version>.tar.gz

2. Alternatively, you may pass the configure arguments
      --with-mysql-dir=<base-dir> (distribution directory)
   or
      --with-mysql-inc=<base-inc> (where MySQL header files reside)
      --with-mysql-lib=<base-lib> (where MySQL libraries reside)
   in the call to R INSTALL --configure-args='...' 

   R CMD INSTALL --configure-args='--with-mysql-dir=DIR' RMySQL_<version>.tar.gz

ERROR: configuration failed for package ‘RMySQL’
* removing ‘/usr/lib/R/library/RMySQL’

MySQLがインストールされている場所にインストールを指示する必要があることは明らかですが、適切なディレクトリの検索を開始する場所がわかりません。私は周りを見回すために次のことをしました：

$> find / -name mysql
/usr/share/mysql
/usr/lib/perl5/vendor_perl/auto/DBD/mysql
/usr/lib/perl5/vendor_perl/DBD/mysql
/usr/lib/mysql
/usr/bin/mysql
/var/lib/mysql
/var/lib/mysql/mysql

そのため、AWSLinuxインスタンスにはさまざまなMySQLディレクトリがあります。インストールパスでどちらを使用しますか？試行錯誤する必要がありますか？

私の他の質問は（RMySQLを正しくインストールすると仮定して）、RMySQLが機能するためには、MySQLサーバーがRもインストールされているのと同じ物理（仮想？）マシンで実行されている必要がありますか？

他の調査によると、MySQLデータベースへのRMySQL接続を機能させるにはSSHトンネルを作成する必要があります。これは本当ですか？私が間違っていなければ、AWSRDSはSSHトンネリングを許可していません。

他に何か提案はありますか？