Ich möchte zur cytoscape.jsVisualisierung von Grafiken verwenden. Während ich mit einer Vielzahl von Sprachen fähig bin ( C++, Mathematica, R, usw.), ich bin neu Javascript, JSON, HTML, und CSS. Daher wäre es günstig, diese Sprachen anhand dieses Anwendungsfalls zu lernen (Implementieren von Graphen mit cytoscape.js). Bitte beachten Sie dies in Ihrer Antwort.
Ich habe zuvor gefragt, wie [aus der Ferne geladen werden soll cytoscape.jsund wie Diagramme angezeigt werden sollen (erfordert a div) . Seitdem habe ich ein Skript erstellt, das ein Diagramm, wie es in einer der anderen von mir verwendeten Sprachen dargestellt wird, in das hierJSON angegebene Format umwandelt . Während ich all dies einfach direkt in mein Programm kopieren und einfügen kann, ist dies für große Netzwerke eindeutig eine schlechte Möglichkeit, es zu implementieren. Ein Beispiel für die Ausgabe meines Skripts finden Sie unten.
JSONWie kann ich bei einem Objekt / einer Datei (?) Folgendes tun:
cytoscape.jsohne den Code zu kopieren.cytoscape.js)cytoscape({
container: document.getElementById('cy'),
elements: [
{// node Node 1
group: 'nodes',
data: {
id: 'Node 1'
},
selected: false,
selectable: true,
locked: false,
grabbable: true,
selectable: true,
},
{// node Node 2
group: 'nodes',
data: {
id: 'Node 2'
},
selected: false,
selectable: true,
locked: false,
grabbable: true,
selectable: true,
},
{// node Node 3
group: 'nodes',
data: {
id: 'Node 3'
},
selected: false,
selectable: true,
locked: false,
grabbable: true,
selectable: true,
},
{// edge 1_2
group: 'edges',
data: {
id: '1_2',
source: '1',
target: '2'
}
},
{// edge 2_3
group: 'edges',
data: {
id: '2_3',
source: '2',
target: '3'
}
},
{// edge 3_1
group: 'edges',
data: {
id: '3_1',
source: '3',
target: '1'
}
}
],
style: [
{
selector: 'node',
style: {
'content': 'data(id)'
}
}
]
});
<head>
<title></title>
<script src="js/vendor/cytoscape.min.js"></script>
<script src="js/vendor/jquery.min.js"></script>
</head>
<style>
#cy {
width: 100%;
height: 100%;
position: absolute;
top: 0px;
left: 0px;
}
</style>
<body>
<div id="cy"></div>
<script>
$.getJSON("cyto.js", function (data) {
//console.log(data);
var cy = cytoscape({
container: document.getElementById('cy'),
elements: data,
style: [
{
selector: 'node',
style: {
'label': 'data(label)',
'width': '60px',
'height': '60px',
'color': 'blue',
'background-fit': 'contain',
'background-clip': 'none'
}
}, {
selector: 'edge',
style: {
'text-background-color': 'yellow',
'text-background-opacity': 0.4,
'width': '6px',
'target-arrow-shape': 'triangle',
'control-point-step-size': '140px'
}
}
],
layout: {
name: 'circle'
}
});
});
</script>
</body>
In cyto.js können Sie beispielsweise gültige JSON-Daten eingeben
{
"nodes": [
{
"data": {"id": "a", "label": "Gene1"}
},
{
"data": {"id": "b", "label": "Gene2"}
},
{
"data": {"id": "c", "label": "Gene3"}
},
{
"data": {"id": "d", "label": "Gene4"}
},
{
"data": {"id": "e", "label": "Gene5"}
},
{
"data": {"id": "f", "label": "Gene6"}
}
],
"edges": [
{
"data": {
"id": "ab",
"source": "a",
"target": "b"
}
},
{
"data": {
"id": "cd",
"source": "c",
"target": "d"
}
},
{
"data": {
"id": "ef",
"source": "e",
"target": "f"
}
},
{
"data": {
"id": "ac",
"source": "a",
"target": "d"
}
},
{
"data": {
"id": "be",
"source": "b",
"target": "e"
}
}]
}
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