免责声明：这是我在biostars.org上问到的有关并行和写入文件的一个更普遍的问题。
当我顺序运行一个程序（obisplit来自obitoolspackage）时，它会读取一个文件并根据原始文件中的某个条件（此处不重要）创建多个文件：
input_file.fastq
|____ output_01.fastq
|____ output_02.fastq
|____ output_03.fastq
但是，当我分割输入文件并并行运行它们时（来自ubuntu repo的版本：20141022），
find . * | grep -P "^input_file" | parallel -j+3 obisplit -p output_{/.}_ -t variable_to_split_on {/}
我希望得到文件
input_file_a.fastq
|____ output_input_file_a_01.fastq
|____ output_input_file_a_02.fastq
|____ output_input_file_a_03.fastq
input_file_b.fastq
|____ output_input_file_b_01.fastq
|____ output_input_file_b_02.fastq
|____ output_input_file_b_03.fastq
input_file_c.fastq
|____ output_input_file_c_01.fastq
|____ output_input_file_c_02.fastq
|____ output_input_file_c_03.fastq
但是输出仅打印到控制台。
是否存在某种内在的parallel因素导致该打印正常进行，或者这可能obisplit是出于某种原因的行为方式？有没有办法说服每个核心命令parallel打印到特定文件而不是控制台？
obisplit如果重定向输出，则听起来好像行为有所不同。
您可以要求GNU Parallel输出到文件：
seq 10 | parallel --results output_{} echo this is input {} >/dev/null
（或者，如果您的版本较旧：
seq 10 | parallel echo this is input {} '>' output_{}
）
它会创建output_#，output_#.err，output_#.seq。
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