非交互式运行IPython / Jupyter笔记本

大卫·申恩

有谁知道是否可以从命令行非交互式地运行IPython / Jupyter笔记本,并将结果.ipynb文件与运行结果一起保存。如果还不可行,用phantomJS实施将有多难,是否需要打开和关闭内核以及如何打开和关闭Web服务器?

更具体地说,假设我已经有一个笔记本,original.ipynb并且我想重新运行该笔记本中的所有单元,并将结果保存到新笔记本中new.ipynb,但是在命令行上使用一个命令执行此操作,而无需在浏览器或浏览器中进行交互。关闭内核或Web服务器,并假设没有内核或Web服务器正在运行。

示例命令:

$ ipython notebook run original.ipynb --output=new.ipynb

马特

是的,有可能而且很容易,它将(大部分)放在IPython 2.0的内核中,我建议现在看看这些示例

[编辑]

$ jupyter nbconvert --to notebook --execute original.ipynb --output=new.ipynb

现在在Jupyter NbConvert中。NbConvert附带了一堆Preprocessor默认情况下处于禁用状态的,其中两个(ClearOutputPreprocessorExecutePreprocessor)很有趣。您可以通过c.<PreprocessorName>.enabled=True(大写的python)在您的(本地|全局)配置文件中启用它们,也可以在命令行--ExecutePreprocessor.enabled=True中将其余的命令照常启用

--ExecutePreprocessor.enabled=True具有方便--execute,可以在最新版本NbConvert的所使用的别名。--inplace如果需要,可以将其与

例如,无头运行笔记本后转换为html:

$ jupyter nbconvert --to=html --execute RunMe.ipynb

剥离输出后转换为PDF

$ ipython nbconvert --to=pdf --ClearOutputPreprocessor.enabled=True RunMe.ipynb

<insert-your-language-here>如果您设置,则(当然)通过生成内核可用于非Python内核--profile=<your fav profile>转换可能真的很长,因为它需要重新运行笔记本。您可以使用该--to=notebook选项进行笔记本到笔记本的转换

根据使用情况,可能需要设置/取消设置其他各种选项(超时,允许错误等)。请参阅文件,当然jupyter nbconvert --help--help-allnbconvert在线文档获取更多信息。

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