我试图BioPerl
在没有root用户的PC上安装新版本的,并收到有关所需模块的版本太旧的错误。所以我将它们安装到一个自定义目录中。
是否可以在--install_base旁边设置用于安装的库参数?README和INSTALL指令仅使用提供安装的目的cpan
,这对我来说是没有选择的。
谢谢
我的尝试:
my $dir=catdir('home','user','my','bioperl');
my $lib=catdir('home','user','my','lib');
push @INC , $lib;
$lib=$lib.':'.$_ for @INC;
1。
system("cd tools/BioPerl-1.6.923 && perl Build.PL --install_base $dir && ./Build test && ./Build install");
2。
system("export EXPATLIBPATH=$lib && cd tools/BioPerl-1.6.923 && perl Build.PL --install_base $dir && ./Build test && ./Build install");
3。
system("export PERL5LIB=$lib && cd tools/BioPerl-1.6.923 && perl Build.PL --install_base $dir && ./Build test && ./Build install");
没有root用户访问权限是一个常见问题,这就是存在的原因perlbrew
。
\curl -L http://install.perlbrew.pl | bash
然后只需安装即可cpanminus
使用perlbrew
:Installing to local perl (perlbrew)
。
curl -L http://cpanmin.us | perl - App::cpanminus
那将使您有一个稳定的环境来安装所有模块,包括Bio::Perl
。可以执行以下操作或也可以阅读How do I install the latest BioPerl version when using perlbrew?
cpanm Bio::Perl
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