从命令提示符运行rpy2

5xum

我正在尝试rpy2使用我的标准python设置。为此,我首先创建了一个测试文件,以查看是否所有内容都可以导入。这是我的档案rtest.py

import rpy2
from rpy2.robjects import r

print dir(r)

从我的python shell运行这3行就可以了,这意味着如果我在IDLE中打开文件并运行它,它将返回一个字符串列表。

但是,当我尝试从命令提示符运行同一文件时遇到问题,我收到以下错误消息:

Traceback (most recent call last):
  File "c:\rtest.py", line 2, in <module>
    from rpy2.robjects import r
  File "C:\Python27\lib\site-packages\rpy2\robjects\__init__.py", line 18, in <module>
    from rpy2.robjects.robject import RObjectMixin, RObject
  File "C:\Python27\lib\site-packages\rpy2\robjects\robject.py", line 5, in <module>
    rpy2.rinterface.initr()
RuntimeError: R_USER not defined.

我不知道为什么python突然找不到R_USER它发现它在标准IDLE环境中没有问题

CT Zhu

您可以尝试在系统变量中添加新的环境变量。R_USER命名为,其值为当前的Windows用户。

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