无法从子流程激活Conda环境

比纳克·萨卡(Binaek sarkar)

我正在构建一个Electron应用程序(运行Angular应用程序),该应用程序充当python下面程序的用户界面

python程序anaconda用于程序包管理(我正在miniconda用于开发)。

应用启动时,它将检查所需的conda环境是否存在,如果不存在,则创建它。

以下代码是的一部分,Service它负责管理python程序。

public doEnvironmentSetup() {
    let stdOutSub = new Subject<string>();
    let stdErrSub = new Subject<string>();
    let completeSubject = new Subject<string>();
    this.runningSetup = true;

    const TEMP_ENV_FILE = join(tmpdir(), "env.yml");

    return Promise.resolve()
      .then(() => {

        // Copy packaged environment.yml to TEMP_ENV_FILE

      })
      .then(() => this.electron.getApplicationStoragePath())
      .then((stor) => {

        setTimeout(() => {

          let runProcess = this.electron.childProcess.spawn("conda", ["env", "create", "--file", TEMP_ENV_FILE, "--name", CONDA_ENV_NAME], {
            cwd: stor
          });

          const stdOutReaderInterface = createInterface(runProcess.stdout);
          const stdErrReaderInterface = createInterface(runProcess.stderr);

          stdOutReaderInterface.on('line', (line) => {
            stdOutSub.next(line);
          });

          stdErrReaderInterface.on('line', (line) => {
            stdErrSub.next(line);
          });

          runProcess.on('close', (code: number) => {
            this.electron.fs.unlinkSync(TEMP_ENV_FILE);
            this.runningSetup = false;
            completeSubject.next("");
          });

        }, 2000);

        return {
          stdOut: stdOutSub,
          stdErr: stdErrSub,
          onComplete: completeSubject
        };

      });

  }

现在,当我需要运行实际的python代码时,运行的代码是(不给出全部内容,因为对于我们这里的目的来说太长了):

        execCmd.push(
          `conda init ${this.electron.os.platform() === "win32" ? "powershell" : "bash"}`,
          `conda activate ${CONDA_ENV_NAME}`,
          // long python spawn command
          `conda deactivate`,
        )

        setTimeout(() => {

          logLineSubject.next({ out: "--- Setting up Execution Environment ---", err: "" });

          logLineSubject.next({ out: `Running in ${dir}`, err: "" });

          const cmd = execCmd.join(" && ");

          let runProcess = this.electron.childProcess.spawn(cmd, {
            detached: false,
            windowsHide: true,
            cwd: cwd,
            shell: this.getShell()
          });

          const stdOutInterface = createInterface(runProcess.stdout);
          const stdErrInterface = createInterface(runProcess.stderr);

          stdOutInterface.on('line', (line) => {
            // get this line back to the component
          });

          stdErrInterface.on('line', (line) => {
            // get this line back to the component
          });

          runProcess.on("error", (err) => {
            // get this back to the component
          });

          runProcess.on('close', (code: number) => {
            // get this line back to the component
          });

        }, 1000);

其中getShell定义为:

private getShell() {
  return process.env[this.electron.os.platform() === "win32" ? "COMSPEC" : "SHELL"];
}

但是,每当我尝试运行此命令时,它都会返回:

CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'.
To initialize your shell, run
    $ conda init <SHELL_NAME>
blah blah blah ...

当我尝试使用时source activate ${CONDA_ENV_NAME},它会返回:

/bin/bash: activate: No such file or directory

不太确定我在这里做错了什么。有人能指出我正确的方向吗?

PS:它可以与一起使用source $(conda info --root)/etc/profile.d/conda.sh,但是由于我也需要支持Windows,所以我不能真正使用它!

免责声明:我是python/的新手anaconda

梅尔

我不确定要在Windows Powershell中运行什么,但是对于bash,您需要运行将conda initbash配置为在启动时运行的脚本,而不是conda init那是,

miniconda3/etc/profile.d/conda.sh

所以应该像

execCmd.push(
    `. ${CONDA_ROOT}/etc/profile.d/conda.sh`,
    `conda activate ${CONDA_ENV_NAME}`,
    // long python spawn command
     `conda deactivate`,
)

我怀疑Windows的情况下运行在的.bat或名为.ps1文件中的一个condabin目录

另外,如果conda已定义,并且您拥有Python脚本(例如script.py),那么您也许可以使用conda run,例如

execCmd.push(
    `conda run -n ${CONDA_ENV_NAME} python script.py`
)

并且可能跨平台工作。请注意,conda run只有最近添加的对交互式I / O的支持,并且必须使用该--live-stream标志将其启用(请参阅v4.9.0发行说明)。否则,它只会缓冲所有击中stdout / stderr的内容,直到进程退出后才返回。

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