使用重命名的输出使目录重命名文件

Panos 发表于 Dev

布料

我有一个包含多个文件的目录，它们都以“ _1.fastq.gz”或“ _2.fastq.gz”结尾

ERR3258060_1.fastq.gz  
ERR3258060_2.fastq.gz  
ERR3258861_1.fastq.gz  
ERR3258861_2.fastq.gz

我想要做的（第一步）是获取所有以_1.fastq.gz结尾的文件，并保留文件名（ERR32 .....）的前10个字符，并使用该文件创建目录

因此目录看起来像ERR3258060 ERR3258861

到目前为止，我已经尝试使用以下bash

for f in *_1.fastq.gz
do
echo $f | rename -n 's/_1.fastq.gz//' * | mkdir
done

该命令以我想要的方式生成文件名，但是mkdir不会采用重命名的输出，它只会说“缺少操作数”，如何使mkdir接受上一个命令的结果？

谢谢

阿里恩霍德

无需使用rename。您可以使用sed。第一步，创建目录名称，然后在中使用它mkdir。

for f in *_1.fastq.gz
do
    dir=$(echo $f | sed 's/_1.fastq.gz//')
    mkdir $dir
done

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编辑于 2021-01-21

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