我遇到的情况是,我有一系列文件,如下所示:
1234_A_data1_v1.ext
1234_A_data1_v2.ext
1234_A_data2_v1.ext
1234_A_data2_v2.ext
1234_B_data1_v1.ext
1234_B_data1_v2.ext
1234_B_data2_v1.ext
1234_B_data2_v2.ext
1234_AA_data1_v1.ext
1234_AA_data1_v2.ext
1234_AA_data2_v1.ext
1234_AA_data2_v2.ext
1234_BB_data1_v1.ext
1234_BB_data1_v2.ext
1234_BB_data2_v1.ext
1234_BB_data2_v2.ext
正则表达式字符串1234_[A-Z]+
标识数据集。我想为每个这样的数据集创建文件夹(基于文件名),然后将相应的文件移动到所述文件夹中。例如,将1234_A_data1_v1.ext,1234_A_data1_v2.ext,1234_A_data2_v1.ext,1234_A_data2_v2.ext放在文件夹1234_A下。
我设法如下创建文件夹:
grep -o -E '^[0-9]+_[A-Z]+' seqnames | xargs echo | xargs mkdir
这给了我:
1234_A
1234_A_data1_v1.ext
1234_A_data1_v2.ext
1234_A_data2_v1.ext
1234_A_data2_v2.ext
1234_B
1234_B_data1_v1.ext
1234_B_data1_v2.ext
1234_B_data2_v1.ext
1234_B_data2_v2.ext
1234_AA
1234_AA_data1_v1.ext
1234_AA_data1_v2.ext
1234_AA_data2_v1.ext
1234_AA_data2_v2.ext
1234_BB
1234_BB_data1_v1.ext
1234_BB_data1_v2.ext
1234_BB_data2_v1.ext
1234_BB_data2_v2.ext
一切都很好。但是现在,我不知道如何将文件移动到各自的文件夹中,这让我很失落。
任何有关如何实现此目标的建议将不胜感激。
特别是,有什么方法可以做类似的事情mv *<pattern>*filename *<pattern>*destination
吗?我也有兴趣了解是否还有其他简洁的方法(也许合适?)来完成此任务。
好吧,如果所有这些文件都遵循您显示的模式并且位于同一目录中,那么这种单线似乎可以正常工作。
$ for d in $( cut -f1-2 -d_ <(ls 1234_*) | sort -u ); do mkdir $d; mv ${d}_* $d; done
此bash命令使用Looping结构 for
,管道 |
,进程替换 <(...)
和命令替换 $(...)
。
ls 1234_*
创建与该模式匹配的所有文件的列表。cut -f1-2 -d_
拆分每个匹配的文件名_
,然后仅输出前两个字段(包括_
这两个字段之间的分隔符)。sort -u
首先对这些cut
前缀进行排序,然后仅输出唯一项。您要使用这些唯一的前缀作为目录名。for
然后遍历这些唯一的前缀,创建目录(mkdir
),并将mv
匹配前缀的文件复制到该新目录。
谨慎使用并根据需要进行调整。如果此目录中还有其他文件或目录,或者在执行命令时出现错误,则由于将创建目录,因此执行或重新执行命令可能无法执行您想要的操作,因为全局将不匹配您想要什么,等等。
这是一个例子。
$ ls -alF # Show the files in the directory
total 8
drwxrwxr-x. 2 user user 4096 Jul 19 02:15 ./
drwxrwxr-x. 34 user user 4096 Jul 19 02:02 ../
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_AA_data1_v1.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_AA_data1_v2.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_AA_data2_v1.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_AA_data2_v2.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_A_data1_v1.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_A_data1_v2.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_A_data2_v1.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_A_data2_v2.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_BB_data1_v1.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_BB_data1_v2.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_BB_data2_v1.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_BB_data2_v2.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_B_data1_v1.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_B_data1_v2.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_B_data2_v1.ext
-rw-rw-r--. 1 user user 0 Jul 19 02:07 1234_B_data2_v2.ext
$ for d in $( cut -f1-2 -d_ <(ls 1234_*) | sort -u ); do mkdir $d; mv ${d}_* $d; done # the one-liner
$ ls -alF # show the directory now
total 24
drwxrwxr-x. 6 user user 4096 Jul 19 02:17 ./
drwxrwxr-x. 34 user user 4096 Jul 19 02:02 ../
drwxrwxr-x. 2 user user 4096 Jul 19 02:17 1234_A/
drwxrwxr-x. 2 user user 4096 Jul 19 02:17 1234_AA/
drwxrwxr-x. 2 user user 4096 Jul 19 02:17 1234_B/
drwxrwxr-x. 2 user user 4096 Jul 19 02:17 1234_BB/
$ tree . # show the whole directory tree structure
.
├── 1234_A
│ ├── 1234_A_data1_v1.ext
│ ├── 1234_A_data1_v2.ext
│ ├── 1234_A_data2_v1.ext
│ └── 1234_A_data2_v2.ext
├── 1234_AA
│ ├── 1234_AA_data1_v1.ext
│ ├── 1234_AA_data1_v2.ext
│ ├── 1234_AA_data2_v1.ext
│ └── 1234_AA_data2_v2.ext
├── 1234_B
│ ├── 1234_B_data1_v1.ext
│ ├── 1234_B_data1_v2.ext
│ ├── 1234_B_data2_v1.ext
│ └── 1234_B_data2_v2.ext
└── 1234_BB
├── 1234_BB_data1_v1.ext
├── 1234_BB_data1_v2.ext
├── 1234_BB_data2_v1.ext
└── 1234_BB_data2_v2.ext
4 directories, 16 files
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