需要从python3中的文本文件中提取表格数据

Steve 发表于 Dev

史蒂夫

我有一个Quantum Chemistry程序的输出，我希望从中提取表格数据以输入到我25年前写的FORTRAN程序的Python端口中。

一些输出文件相当长，多达6000行，因此无法使用电子表格进行处理。

典型的表格具有以下形式：

                             CARTESIAN COORDINATES

   1    C        0.011987266    -0.003842185     0.006578784
   2    H        1.097152909    -0.003956163     0.013339310
   3    H       -0.349612312     1.019316731     0.001903075
   4    H       -0.344276148    -0.517463019    -0.880495291
   5    H       -0.355315644    -0.513266496     0.891567896

我并不是要有人为我编写Python代码，而是要在可用代码的迷宫中给我一些指导。

Hami

我建议您调查np.genfromtxt。以下代码段将从存储在名为的文件中的问题中读取示例数据data.txt。

import numpy as np
data = np.genfromtxt('data.txt', skip_header=2, dtype=[('id', 'i8'),('label','S1'),('x','f8'),('y','f8'),('z','f8')])
print(data)

输出量

 [(1, b'C',  0.01198727, -0.00384219,  0.00657878)
 (2, b'H',  1.09715291, -0.00395616,  0.01333931)
 (3, b'H', -0.34961231,  1.01931673,  0.00190307)
 (4, b'H', -0.34427615, -0.51746302, -0.88049529)
 (5, b'H', -0.35531564, -0.5132665 ,  0.8915679 )]

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