因此,我已经尝试在这里检查(几乎)同一主题的其他问题,但是没有找到解决我问题的方法。
基本上,我在Python中有一段代码试图将文件作为数据框打开并执行一些眼睛跟踪功能(PyGaze)。我有1000个文件需要分析,并且想要创建一个for循环以自动对所有文件执行代码。
代码如下:
os.chdir("/Users/Documents//Analyse/Eye movements/Python - Eye Analyse")
directory = '/Users/Documents/Analyse/Eye movements/R - Filtering Data/Filtered_data/Filtered_data_test'
for files in glob.glob(os.path.join(directory,"*.csv")):
#Downloas csv, plot
df = pd.read_csv(files, parse_dates = True)
#Plot raw data
plt.plot(df['eye_x'],df['eye_y'], 'ro', c="red")
plt.ylim([0,1080])
plt.xlim([0,1920])
#Fixation analysis
from detectors import fixation_detection
fixations_data = fixation_detection(df['eye_x'],df['eye_y'], df['time'],maxdist=25, mindur=100)
Efix_data = fixations_data[1]
numb_fixations = len(Efix_data) #number of fixations
fixation_start = [i[0] for i in Efix_data]
fixation_stop = [i[1] for i in Efix_data]
fixation = {'start' : fixation_start, 'stop': fixation_stop}
fixation_frame = pd.DataFrame(data=fixation)
fixation_frame['difference'] = fixation_frame['stop'] - fixation_frame['start']
mean_fixation_time = fixation_frame['difference'].mean() #mean fixation time
final = {'number_fixations' : [numb_fixations], 'mean_fixation_time': [mean_fixation_time]}
final_frame = pd.DataFrame(data=final)
#write everything in one document
final_frame.to_csv("/Users/Documents/Analyse/Eye movements/final_data.csv")
该代码正在运行(没有错误),但是:它仅对第一个文件运行。没有为文件夹/目录中存在的其他文件运行该代码。我看不出我的错误在哪里?
您的输出文件名是常量,因此每次for循环迭代都会覆盖它。请尝试以下操作,而不是最后一行,它以“附加”模式打开文件:
#write everything in one document
with open("/Users/Documents/Analyse/Eye movements/final_data.csv", "a") as f:
final_frame.to_csv(f, header=False)
本文收集自互联网,转载请注明来源。
如有侵权,请联系 [email protected] 删除。
我来说两句