com.fasterxml.jackson.databind.exc.MismatchedInputException：无法反序列化实例吗？

350

Goodyzain：

嗨，我正在尝试读取以下json字符串的所有可能的更改，但仍然出现以下错误，我的json是字符串有效且问题是子元素映射有问题

这是我的json字符串

[
    {
        "denotations": [
            {
                "id": [
                    "CUI-less"
                ],
                "obj": "disease",
                "span": {
                    "begin": 31,
                    "end": 41
                }
            }
        ],
        "elapsed_time": {
            "ner": 2.759,
            "normalization": 0.002,
            "tmtool": 0.148,
            "total": 2.91
        },
        "logits": {
            "disease": [
                [
                    {
                        "end": 41,
                        "id": "CUI-less",
                        "start": 31
                    },
                    0.999957799911499
                ]
            ],
            "drug": [],
            "gene": [],
            "species": []
        },
        "project": "BERN",
        "sourcedb": "PubMed",
        "sourceid": "2832773",
        "text": "Absence of humoral immunity to poliovirus in vaccinated individuals.",
        "timestamp": "Thu Aug 06 13:42:27 +0000 2020"
    }
]

我的Java Pojo（Logit的课程）

import java.util.HashMap;
import java.util.List;
import java.util.Map;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonAnyGetter;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonAnySetter;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonIgnore;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonInclude;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonProperty;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonPropertyOrder;

@JsonInclude(JsonInclude.Include.NON_NULL)
@JsonPropertyOrder({
    "disease",
    "drug",
    "gene",
    "species"
})
public class Logits {

    @JsonProperty("disease")
    private List<List<Disease>> disease = null;
    @JsonProperty("drug")
    private List<Object> drug = null;
    @JsonProperty("gene")
    private List<Object> gene = null;
    @JsonProperty("species")
    private List<Object> species = null;
    @JsonIgnore
    private Map<String, Object> additionalProperties = new HashMap<String, Object>();

    @JsonProperty("disease")
    public List<List<Disease>> getDisease() {
        return disease;
    }

    @JsonProperty("disease")
    public void setDisease(List<List<Disease>> disease) {
        this.disease = disease;
    }

    @JsonProperty("drug")
    public List<Object> getDrug() {
        return drug;
    }

    @JsonProperty("drug")
    public void setDrug(List<Object> drug) {
        this.drug = drug;
    }

    @JsonProperty("gene")
    public List<Object> getGene() {
        return gene;
    }

    @JsonProperty("gene")
    public void setGene(List<Object> gene) {
        this.gene = gene;
    }

    @JsonProperty("species")
    public List<Object> getSpecies() {
        return species;
    }

    @JsonProperty("species")
    public void setSpecies(List<Object> species) {
        this.species = species;
    }

    @JsonAnyGetter
    public Map<String, Object> getAdditionalProperties() {
        return this.additionalProperties;
    }

    @JsonAnySetter
    public void setAdditionalProperty(String name, Object value) {
        this.additionalProperties.put(name, value);
    }

}

甚至尝试过String [] []疾病仍然无法解析，请让我知道我在这里想念的是什么

解析代码

 String denotations = restTemplate.getForObject("http://com/text",String.class);
       System.out.println(denotations);
       ObjectMapper mapper = new ObjectMapper();
       BernOBJ denoObj = mapper.readValue(denotations, BernOBJ.class);
       System.out.println(denoObj);

堆栈跟踪

com.fasterxml.jackson.databind.exc.MismatchedInputException：无法反序列化以下实例 com.goodyzain.bern.models.BernOBJ不在START_ARRAY令牌的[来源：（String）“ [{”代名词“：[{” id“：[” CUI-less“]，” obj“：”疾病“，” span“：{”开始“：31 ，“ end”：41}}]，“ elapsed_time”：{“ ner”：2.759，“ normalization”：0.002，“ tmtool”：0.148，“ total”：2.91}，“ logits”：{“疾病”：[ “ [截断了555个字符]；第1行，第1列，位于com.fasterxml.jackson.databind.exc.MismatchedInputException.from（MismatchedInputException.java:59）〜com.fasterxml的[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]。 jackson.databind.DeserializationContext.reportInputMismatch（DeserializationContext.java:1468）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1] at com.fasterxml.jackson.databind.DeserializationContext.handleUnexpectedToken（DeserializationContext。

谢尔盖：

您当前遇到的错误：

Cannot deserialize instance of com.goodyzain.bern.models.BernOBJ out of START_ARRAY token at [Source: (String)"[ {

表示您有一个JSON对象数组（以开头[{...），但尝试将其解析为一个对象：

BernOBJ denoObj = mapper.readValue(denotations, BernOBJ.class);

通常应该将数组解析为值列表，例如：

List<BernOBJ> denoObj = mapper.readValue(denotations, 
  mapper.getTypeFactory().constructCollectionType(List.class, BernObj.class));

另外，您的List<List<Disease>>列表并不完全包含Disease对象，它包含一个对象和一个double值：

[
    [
        {
            "end": 41,
            "id": "CUI-less",
            "start": 31
        },
        0.999957799911499
    ]
]

我不确定那里是否总是有一个对象和一个数值，以及它的含义，但是您可以执行以下操作。创建一个附加类，例如DiseasePair，并像这样映射它：

@JsonFormat(shape = JsonFormat.Shape.ARRAY)
@JsonPropertyOrder({ "disease", "numericValue" })
class DiseasePair {

    private Disease;

    private Double numericValue;

}

然后将您的List<List<Disease>>字段类型更改为List<DiseasePair>。

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