我正在尝试将BioPython序列传递给iya笔记本环境中Ilya Stepanov的Ukkonen后缀树算法的实现。我绊倒了argparse组件。
我以前从来没有直接处理过argparse。如何在不重写main（）的情况下使用它？
顺便提一下，这个书面记录Ukkonen算法的是太棒了。
我之前也遇到过类似的问题，但是使用optparse代替argparse。
您无需更改原始脚本中的任何内容，只需分配一个新列表即可sys.argv：
if __name__ == "__main__":
from Bio import SeqIO
path = '/path/to/sequences.txt'
sequences = [str(record.seq) for record in SeqIO.parse(path, 'fasta')]
sys.argv = ['-f'] + sequences
main()
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