解决了
我需要能够计算输出文件中所有字符串中的'N'数量。但是，当我打印结果时，我总是得到0或无。有人在我的代码中看到错误吗？
def ncount(filename):
count = 0
with open(filename, 'r') as file:
for words in file:
if words in file == "N":
count = count + 1
return count
count = ncount("output_seq.txt")
print(count)
输出文件如下所示：
["GATTTTCTATGACATCTAGAAGAAAAAGAAAGACTATAAGATGTATAAAAACAAGAGGNNCNGAGAAAATCGAGACAGGTGGTGAGAATCTGCCGAATTAN",
"AACATTGCTGAGAGGTTCGATCGTGATCCCTGCAAGAAAAAATAAAGGTGGAGATGATNNCNCAATGTATGTTGTCTCGTCACACTGGTTTAATGATTTTN",
"CTTTTTTTTAAATATTTCGGGCGGTAATTTTTTCTGCCATCTTTTTCACTAAGAAAACTTTCAGGCGTTGTTAAGCGGTGGAATCTATAGAGCTGTCTCTT",
"ATGTATCTAACGAGACAGCAATGGGAATTTTGTATTAAAAAAAAGAAGAAATACATATTTTGAAACAGGAATGTTGTTTGATTTTTAAAGAAAAAAGGAAA",
"TCCAGACGCAAAANNNNNNNNTTTTTGTCTCAAGACTACAGTACCCTGGGTCTCGCCACGAAAATTGTTTGTTAAATGAGAAAATGTGTGCGCCTTTAAAG",
""]
这是一个虚拟文件，仅包含5个序列。实际文件包含数千个这些字符串
我一直收到的输出是：
0
用于file.readlines()将文件作为字符串逐行迭代。然后，您可以简单地使用count()计算字符串中术语出现的方法：
def ncount(filename):
count = 0
with open(filename, 'r') as myfile:
for line in myfile.readlines():
count += line.count('N')
return count
count = ncount("somefile.txt")
print(count)
对于您的"output_seq.txt"文件，此输出16。
本文收集自互联网，转载请注明来源。
如有侵权，请联系 [email protected] 删除。
我来说两句