我在Red Hat Enterprise Linux 6上使用R 3.4.1。我asreml在下安装了3.0版的软件包/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library。
> library(asreml)
Loading required package: lattice
Checking for license <redacted>
> .libPaths()
[1] "/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library"
该软件包的第4版现已发布，但我们想将第3版和第4版的结果进行比较。为此，我们希望在系统上安装第4版asreml4。我已经下载了* tar.gz文件的最新版本，但是如果我下载了
R CMD INSTALL asreml_4.1.0.93.tar.gz
它将安装在asreml文件夹中，覆盖旧版本。那不是我想要的
我还尝试将其安装在另一个位置，将该文件夹重命名为asreml4，然后将该文件夹复制到/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library，然后尝试加载它，但是随后加载了错误的版本：
> library(asreml, lib.loc="/tools/bioinfo/app/R-3.4.1/lib64/R/library/asreml4")
> packageVersion("asreml")
[1] ‘3.0.1’
那么，如何以asreml4可以调用它的方式将其安装在文件夹中library(asreml4)？
1）编辑DESCRIPTION下载源代码，编辑DESCRIPTION文件以使用其他名称，然后构建并安装它。
2）单独的库或者将新版本安装到单独的库中，然后使用其中之一来获取所需的版本：
library(asreml, lib = ...)
library(asreml)
2a）.libPaths的一种变体是.libPaths(new)用于更改默认库路径，发出
library(asreml)
然后改回来。
2b）dev_mode完成库切换的一种简单方法是dev_mode()不带参数使用（来自devtools包）。dev_mode()发出第一个命令后，默认库变为〜/ R-dev。那时，使用普通install.packages命令安装新版本的asrmel，而无需指定lib=该命令，它将被安装到〜/ R-dev中。在library不指定库的情况下使用加载它会导致它首先查看〜/ R-dev。然后进行测试，最后在准备好切换回原始库和原始asreml问题时dev_mode()再次进行测试。dev_mode()操作默认的库路径，以便您可以随时使用.libPaths()不带参数的参数来检查当前的默认值。
library(devtools)
dev_mode() # ~/R-dev now default library
# ...
dev_mode() # restore usual default library
本文收集自互联网，转载请注明来源。
如有侵权，请联系 [email protected] 删除。
我来说两句