计算数组中非Nan值的数量

加布里埃尔

我有一个float / nan值列表，看起来像这样：

a = [(9.62, np.nan, 0.063), (np.nan, np.nan, np.nan), (np.nan, 0.34, np.nan), (9.50, 2.65, 5.85), (np.nan, np.nan, np.nan), (8.9423173497260166e-06, np.nan, np.nan), (np.nan, np.nan, np.nan), (10.53906499271581, np.nan, 3.4981897643207153e-08), (27.945228892337656, np.nan, np.nan), (np.nan, np.nan, np.nan), (0.00015676098048248007, 428.53224664333368, 15.597030989617416), (3.219339103511719e-08, np.nan, np.nan), (351.3486881626871, 118.79412856376891, 96.925698744436318), (np.nan, np.nan, np.nan), (np.nan, np.nan, np.nan), (0.038185812702743384, 0.011979539923543838, 1.4161404311887908e-05), (6.5891883211951452, np.nan, np.nan), (np.nan, np.nan, np.nan), (np.nan, np.nan, np.nan), (np.nan, np.nan, np.nan), (0.01992113565158183, 1.0858887135978378e-08, 6.949483102803238e-08), (np.nan, np.nan, np.nan), (0.0053471054969118897, 32.364223190908589, 0.29950485126829518), (0.022687094833899225, np.nan, 3.3927513616780456e-05), (0.0065459356887503, 5.0304474154655309e-06, 6.1755309734841293e-06), (1.2854278279876815e-07, 110.94572059986106, 2.0737305081677166e-06), (2.8909153747692473, np.nan, np.nan), (np.nan, np.nan, np.nan), (0.00085244354118369653, np.nan, 547.28608997823414), (0.21609437779080298, 2.9772785752782283e-08, 0.024868855470372788), (np.nan, 1.0571674432090431e-08, np.nan), (np.nan, 0.00042711039439664552, np.nan), (np.nan, 3.7576842775630178e-09, np.nan), (np.nan, 1.2436122988008544e-08, np.nan), (np.nan, 0.008772060008242254, np.nan), (np.nan, 2.9731267579988852, np.nan), (np.nan, 152.69348161610276, np.nan), (np.nan, 1.7976907012194907, np.nan), (np.nan, 0.0006232073677262973, np.nan), (np.nan, 1.3468250342036237e-08, np.nan), (np.nan, 6.9699321813542907e-05, np.nan), (np.nan, 5.2001506649804148e-05, np.nan), (np.nan, np.nan, np.nan)]

即：的由N子列表，每一个包含相同数量的元素M（在此情况3，但它可能会改变），其中每一元素可以是一个浮动或np.nan值（我的实际列表具有大得多的N和M值）。

我需要有效地计算每个子列表中非 np.nan值的数量。如果数字为零（所有np.nan值），np.nan则应存储一个值。

最终的列表/数组看起来像（a上面使用）：

count = [2, nan, 1, 3, ...]

我尝试使用np.count_nonzero（），但是它算作np.nan非零值，因此它将所有计数都返回为3。

智慧

可以使用numpy.isnan以创建一个布尔数组，然后计数真s的sum每行（轴= 1）：

import numpy as np
# count the non-nan values
non_nans = (~np.isnan(a)).sum(1)

# replace 0 count with np.nan
np.where(non_nans == 0, np.nan, non_nans)
# array([  2.,  nan,   1.,   3.,  nan, ...])

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