我正在尝试加载从 github 存储库https://github.com/VCCRI/SPAGI/tree/master/data下载的 .RData 文件。
在我的计算机上保存文件后，如果我尝试加载其中一个
load("./data/pathwaypath.RData")
我收到错误消息：
Warning message:
“file ‘pathwaypath.RData’ has magic number ''
Use of save versions prior to 2 is deprecated”
Error in load("./data/pathwaypath.RData"): bad restore file magic number (file may be corrupted) -- no data loaded
Traceback:
1. load("./data/pathwaypath.RData")
它也不适用于 readRDS：
readRDS("./data/pathwaypath.RData")
投掷
Error in readRDS("./data/pathwaypath.RData"): unknown input format
Traceback:
1. readRDS("./data/pathwaypath.RData")
浏览 stackoverflow 时，我意识到用于创建 .RData 对象的序列化协议可能存在问题。有人会知道更多吗？这个问题有任何已知的解决方案吗？
我正在运行 R 版本 4.0.0 (2020-04-24)。
这是一种在版本上对我有用的方法3.6.3：
temp <- tempfile()
download.file("https://github.com/VCCRI/SPAGI/blob/master/data/pathway.path.RData?raw=true",temp)
load(temp)
pathway.path[[1]][1:3]
#[[1]]
#[1] "RTN4R" "NGFR" "IRAK1" "MAP3K7" "IKBKB" "NFKB1"
#
#[[2]]
#[1] "RTN4R" "NGFR" "IRAK1" "MAP3K7" "IKBKB" "FOXO3"
#
#[[3]]
#[1] "RTN4R" "NGFR" "MAPK8" "JUN"
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