在Bash命令行中对文件运行R函数

我正在尝试对给定目录中的所有文件迭代用R（strandcode.txt）用R编写的函数。

twincode.txt如下所示，它是计算卡方检验的简单函数。

strand <- function(file){
data <- as.data.frame(read.table(file))
colnames(data) <- c('chr', 'pos', 'fwd', 'bkwd')
data$chi <- ((.5 - (data$fwd / (data$fwd + data$bkwd)))^2)/.5
keep <- data[data$chi < .823, ]
return(keep)
}

strand{$i}

当我在Linux服务器上运行此命令时，我正在使用Rscript并通过以下命令遍历目录中的所有文件。

for i in $( ls ); do Rscript strandcode.txt >> strandout.txt; done

但这给我一个错误错误：“ strand {”中的意外'{'

我也尝试了以下命令行（将最后一行从strandcode.txt中删除）

for i in $( ls ); do Rscript strandcode.txt; Rscript strand{$i} >>     strandout.txt; done
for i in $( ls ); do Rscript strandcode.txt strand{$i} >> strandout.txt; done

两者都运行没有错误，也没有向我的输出文件输出任何内容。

任何建议将不胜感激。谢谢！