图聚类算法

协议

我可以解释我在寻找什么的最好方法是使用这张图片:

在此处输入图片说明

显然,视觉辅助使我们更容易对这些图进行分组,但我也认为找到密集的子图应该是使用算法可以解决的问题。由于它的流行,我尝试了 MCL 算法,但它无法正常工作,因为它似乎至少不允许有方向的边缘。我试图以不同的方式加权边缘,但这也无助于聚类过程。我想在图中找到密集点,并且我确实有一种方法可以验证给定的集群是否可行,但在某些情况下,如果有帮助,某些元素就无法在一起。

其输出将是:

集群 0:A、B、C

第 1 组:D、E、F、G

在这种情况下,如果 D 是一个可疑元素,使用不同的方法我可以找出属于哪个集群。

射线

这个问题本身就是一个研究领域(也是我博士论文的一部分......)最好的解决方案通常取决于你对“集群”或“社区”的数学定义。例如,您可以最小化簇间边的数量,这称为图分区问题

Fortunato 写了一篇关于这个主题的很好的评论论文:https : //arxiv.org/pdf/0906.0612

除了我们自己的方法之外,我个人最喜欢的是模拟退火。

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