将所有 fastq 文件压缩为 fastq.gz

生物资讯

我确实有这样的 fastq 文件名:

Soil-53_R1_001.fastq Root-29_S27_L001_R2_001.fastq
Soil-53_R2_001.fastq Root-2_S35_L001_R1_001.fastq
Soil-54_R1_001.fastq35_fast20Soil -53_R2_001.fastq Root-2_S35_L001_R1_001.fastq Soil-54_R1_001.fastq35_fast20Soil-53_R2_001.fastq Root_fast20_Soil
-53_R2_Fastq0S

我希望它们都以 fastq.gz 格式压缩,请建议我如何使用单个命令执行此操作。

凛风
gzip *.fastq

将为任何以 .fastq 结尾的文件创建一个压缩文件

gzip -r {dir}

将为在 {dir} 中找到的任何文件创建一个压缩文件。

(gzip压缩本身从不创建1个文件。你可以使用tarz用于压缩选项)

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