我正在尝试使用plink将.vcf文件转换为.ped文件。我已经在线阅读了一些手册和帖子,但是似乎没有人特别提及如何将vcf转换为ped。
我希望这里可能会有一些具有plink经验的专家,可以将vcf转换为ped。如果您能分享知识,我将不胜感激。此外,如果还有其他方法(非链接),请共享。
谢谢!
我使用VCFtools将vcf文件转换为PLINK格式(ped,fam,map):https ://vcftools.github.io/man_latest.html
我的命令如下所示:
vcftools --vcf my_data.vcf --out my_data --plink
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