我正在尝试编辑一些fastq文件。
本质上，我想更改：
@SRX1409044.10.1 10 length=80
至：
@SRX1409044.10/1 10 length=80
对于.1文件中包含的每一行。
我试过使用sed：
sed 's#.1#/1#g'
它适用于大多数行，但是适用于以下行：
@SRX1409044.11.1 11 length=80
我得到：
@SRX1409044./1/1 /1 length=80
我到处搜寻了，我想我可能必须逃脱特殊字符？我碰到的每篇帖子都只给出了自己交换特殊字符的示例，因此我不太确定该怎么做。
此命令将每行的第一次出现.1 （点号后跟a1和一个空格）更改为/1 –注意转义.：
sed 's|\.1 |/1 |' infile
对于示例输入文件，例如
@SRX1409044.10.1 10 length=80
@SRX1409044.12.1 10 length=80
@SRX1409044.14.1 10 length=80
@SRX1409044.15.1 10 length=80
@SRX1409044.990.1 10 length=80
结果是
@SRX1409044.10/1 10 length=80
@SRX1409044.12/1 10 length=80
@SRX1409044.14/1 10 length=80
@SRX1409044.15/1 10 length=80
@SRX1409044.990/1 10 length=80
现在，如果.1也可能在一行的末尾，我们必须稍稍更改命令，因为此刻我们需要一个空格：
sed 's#\.1\( \|$\)#/1\1#' infile
这是“.1后跟一个空格或该行的末尾，替换为/1以及后面的任何内容.1”。例如：
$ sed 's#\.1\( \|$\)#/1\1#' <<< 'SRX1409044.116884523.1'
SRX1409044.116884523/1
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