使用AWK进行列操作

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我有一个超过200列的文件。出于示例目的,我在这里使用的列数较少的文件(9)。下面是输入文件(几行)

chr10   181243  225933  1   1   1   10  0   36
chr10   181500  225933  1   1   1   106 0   35
chr10   226069  255828  1   1   1   57  0   37
chr10   243946  255828  1   1   1   4   0   27
chr10   255989  267134  1   1   1   87  0   32
chr10   255989  282777  1   1   1   61  0   34
chr10   267297  282777  1   1   1   61  0   37
chr10   282856  283524  1   1   1   92  0   35
chr10   282856  285377  1   1   1   1   0   15
chr10   283618  285377  1   1   1   72  0   33

我想重新排列文件,使我的最后一列(这里是第9列)在输出文件中是第4列,然后打印其他所有内容。所以我正在寻找的输出是

chr10   181243  225933  36  1   1   1   10  0
chr10   181500  225933  35  1   1   1   106 0
chr10   226069  255828  37  1   1   1   57  0
chr10   243946  255828  27  1   1   1   4   0
chr10   255989  267134  32  1   1   1   87  0
chr10   255989  282777  34  1   1   1   61  0
chr10   267297  282777  37  1   1   1   61  0
chr10   282856  283524  35  1   1   1   92  0
chr10   282856  285377  15  1   1   1   1   0
chr10   283618  285377  33  1   1   1   72  0

在列数较少的文件上,我可以使用类似以下的方法来实现以上输出:

awk -v OFS="\t" '{print $1,$2,$3,$9,$4,$5,$6,$7,$8}'

如果现在我有一个包含大量列的文件,如何将文件的最后一列放置为第四列,而其余部分照原样打印呢?

格伦·杰克曼

Perl对此非常简洁:将每一行分割成多个单词,弹出最后一个单词并将其插入索引3(从0开始)

$ perl -lane 'splice @F, 3, 0, pop(@F); print "@F"' file | column -t
chr10  181243  225933  36  1  1  1  10   0
chr10  181500  225933  35  1  1  1  106  0
...

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